几个世纪以来，没有人知道是谁建造了巨石阵，也没有人知道巨石阵的真正用途，而古老的传说和人们的种种推测，让巨石阵更增加了神秘的氛围。
许多年以来，巨石阵吸引了众多的人们对它进行考察，人们对这座巨石阵的用途做出了种种猜测，主流的猜测有这么几种：
一、祭祀场所
二、王族墓地、贵族墓地
三、节庆场所
四、治疗中心
五、天文平台
前三项比较好理解，第四、第五项可以稍作解释。
考古学家推测，史前人类来到此地的原因或许是认为这里的石头具有治病的“神力”。史前时代，生病或受伤的人们怀着一种悲伤、绝望的心情来到巨石阵，冀望“神石”能帮助他们康复，一些考古发现也表明，巨石阵曾经是史前朝圣者的“治疗和康复中心”。
“天文平台说”当然也是主流，因为牛津大学的霍金斯教授通过仔细观察和严密的计算认为通过巨石阵石环和土环的结构关系，可以精确了解太阳和月亮的十二个方位，并观测和推算日月星辰在不同季节的起落。
当然，也有一些非主流的猜测：
比如认为这是外星人留下的传送装置、以便有朝一日进行文明侵略。
比如认为这只不过是上古神明遗留的餐桌，没什么卵用。
比如认为这是史前人类用来抵御和反击域外侵入所建造的法阵。